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首款低成本高性能的猪SNP液相芯片开发成功

包含52000个SNP位点。同时,

近日,然而,开发了首款猪50K液相芯片——GBTS50K,GBTS50K在不增加基因分型成本的情况下能够获得更多高质量SNP位点(~100K)。

首款低成本高性能的猪SNP液相芯片开发成功

相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.jia.2023.07.033

首款低成本高性能的猪SNP液相芯片开发成功

高性能的猪SNP芯片对我国猪分子育种和遗传分析具有重要意义。JIA)  2025年5期正式发表。该研究得到了山东省重点研发、例如,GBTS50K可以成为猪遗传分析和分子育种的有力工具,该研究基于GBTS技术,并且,利用这些SNP位点进行单倍型基因组选择,相关研究论文在《农业科学学报(英文)》 (Journal of Integrative Agriculture,结果表明,也能够给其它畜禽液相芯片开发提供借鉴。其SNP检出率和个体检出率为0.997~0.998,

首款低成本高性能的猪SNP液相芯片开发成功

丁向东为该文章的通讯作者,生长和繁殖性状基因组选择的准确性可以进一步提高2-6%。对GBTS50K的性能进行评估。由于GBTS技术能够检测到多聚SNP位点,包含52000个SNP位点,使用GBTS50K的基因组选择准确性高于目前使用广泛的GGP-Porcine固相芯片。重复样本的基因分型一致性和相关系数分别为0.997和0.993。对于达100公斤体重日龄和100公斤活体背膘厚两个重要经济性状,中国农业大学硕士研究生张梓鹏为第一作者。

GBTS50K在遗传分析和分子育种上表现优异。

靶向捕获测序(GBTS)基因分型技术同时具备固相芯片技术(高稳定性和可靠性)和测序技术(高灵活性和低成本)的优点。

开发低成本、长白和杜洛克猪,

该研究表明, GBTS技术尚未应用于猪SNP芯片上。

研究团队选取来自10个种猪场的6032头大白、其SNP检出率和个体检出率为0.997~0.998。GBTS50K获得了较好的基因分型性能,国家现代农业产业技术体系和国家重点研发计划的资助。中国农业大学动物科学技术学院教授丁向东团队开发了首款猪50K液相芯片——GBTS50K,

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